Отвечает Юрий Александрович Пейсахович:
Скрытыми папками - файл подкачки, информация о восстановлении, файл спящего режима.
Отвечает Mark Shor:
Скрытыми файлами операционной системы, в частности тем же pagefile.sys, который у меня, например 1.5 Гб.