Windows XP Professional SP1, HDD SATA 120 Gb Seagate Barracuda 7200 (8 Mb кэш), разбит на 6 частей, MB Intel 865 PERL. После загрузки системы очень долго (2-3 минуты) ищет диски. То есть только через это время они появляются в Проводнике.

Возможно, у вас при старте системы загружается антивирусный монитор, который начинает сканировать ваши диски, тормозя работу системы. Отключите его автозагрузку.

Чем больше разделов, тем дольше будут считываться данные. Сократите хотя бы до трёх.

У меня 6 физических дисков (2х250, 4х320), каждый из которых разбит на 2-3 раздела, при этом загрузка проходит быстро, менее минуты это уж точно.Рекомендую почистить систему, проверить альтернативным антивирусом, проверить режим работы диска, посмотреть - нет ли в корневом каталоге каждого раздела файлов с именами: autorun, особенно если последнее время пользовались флешками. Если есть, то срочно к доктору - лечиться.