Возможно ли восстановить данные? После того, как файловая система была сконвертирована из NTFS в FAT32, большинство папок на диске поменяли свои имена на «??????», и открывать такие папки и файлы невозможно. Я пробовал конвертировать обратно в NTFS, не помогло.

Данные вы теперь навряд ли восстановите. Запомните на будущее, что конвертировать можно только FAT32 в NTFS, средств для корректного обратного конвертирования не существует, только переформатирование разделас восстановлением данных из копии.

NTFS -> FAT32 -- опасная штука. Я как-то конвертировал, все обошлось, но если папки назывались по-русски, то будет тяжело (вообще не рекомендую файлы по-русски называть, ничего хорошего от этого не бывает). В таком случае, нужно файлы переместить на другой раздел, потом отформатировать его (пустой уже) под FAT32, и переместить все на него обратно.Попробуй Norton DiskDoctor или просто виндозный chkdsk, может, что выйдет.