На DVD-диске с фильмами имеются файлы с расширениями *.BUP, *.IFO, *.VOB. Какие из этих файлов содержат меню диска и можно ли его как-нибудь изменять? Можно ли записать выборочно несколько файлов фильмов (с расширением *.VOB) с разных DVD-дисков на один, и как потом создать для них новое меню?

Ищите самую длинную цепочку из файлов вида VTS_XX_0.VOB, VTS_XX_1.VOB, VTS_XX_2.VOB и т.д. - это и будет сам фильм, а файл VTS_XX_0.VOB - меню. XX - число 01 или 02 или 03 и т.д., зависит от конкретного диска. Слегка подредактировать (убрать "лишние" кнопки, например) можно с помощью программы MenuEdit. Что бы сделать что-то посерьезней, изучай авторинг (и реавторинг), хорошая статья на эту тему: http://www.ixbt.com/divideo/reauthoring.shtml.

IFO - информационные файлы. Показывают плееру, в каком *.VOB что находится. VOB - собственно, аудио и видеопотоки. А для перекройки меню нужны программы авторинга (Sonic ReelDVD, например).