Отвечает Геннадий:
Могут, но у первых выпусков плат, поддерживающих SATA, были проблемы (невозможность одновременной работы первого канала IDE и SATA), которые решались перепрошивкой новой версии BIOS.
Отвечает Shurovik:
Очень даже могут! И прекрасно работают (у меня именно так). Только на каждый канал SATA можно установить один диск. И режим работы SATA контроллера должен быть "Combined" (настраивается в БИОС).