Отвечает Хайлов Константин Юрьевич:
FAT32 хуже NTFS тем, что: нельзя хранить файлы более 4 Гб, менее устойчив к сбоям, гораздо быстрее фрагментируется, большой размер кластера.
Отвечает Жариков Игорь:
Размер кластера (минимально допустимый размер файла) файловой системы FAT32 зависит от емкости винта (либо раздела) и если сделать большой раздел в FAT32, ты получишь огромные кластеры и тогда даже если твой файл будет занимать только 1 Кб, на винте он займет один кластер целиком, а это будет больше 32 Кб, а если таких файлов будет мноого (а у операционки их действительно очень много), то ты будешь терять пространство. Делай NTFS.
Отвечает TU-154:
Проблема в том, что FAT32 на разделах больше 32 Гб может работать нестабильно - могут начаться проблемы с сохранностью файлов и целостностью самой файловой системы. Это помимо огромного размера кластера на таких дисках.
Отвечает Alexey:
Windows 9x некорректно работают с разделами более 32 Гб, к тому же размер кластера при этом 32 Кб и более, что очень неэкономно для маленьких файлов. наличие только 1000 файлов по одному байту заберет под себя 32 Мб и более дискового пространства. Еще в Windows 9x наблюдалось разрушение информации, находящейся за пределами 120 Гб - при попытке записи в кластеры выше 120 Гб запись велась в начало диска...