Поставил второй винчестер, отформатировал, перенёс всё со старого, установил на него систему. Хотел отформатировать старый — не получается! Пишет Windows не может завершить форматирование. В чем проблема?

Windows использует старый диск. В оснастке Администрирование - Управление компьютером - Управление дисками можно удалить с него раздел и отформатировать.

Делай из-под DOS или с Реаниматора. Можешь отключить новый винт, чтоб не перепутать случайно, и форматируй на радость. Из-под Windows нежелательно такие операции производить.

На шлейфах и перемычках поставь новый диск мастером, а старый слэйвом. Если надо, в Биосе укажи, что новый HDD - мастер. Перезагрузись. Винда загрузится с нового жесткого. Теперь с разделами старого диска можешь делать что захочешь.

Лучше по отдельной ОС на каждом винчестере. При установки каждой из них желательно выключать питание на не нужном винчестере - для безопасности. А после через БИОС выбирать загрузку с желаемого винчестера. :)