Отвечает Юрий Александрович Пейсахович:
Ну, так надо, наконец, выполнить то, что система просит - в командной строке набрать chkdsk /f. Система проверит диск и успокоится.
Отвечает Markiz:
Можно по другому: свойство (диска С) - сервис - выполнить проверку - перезагрузка.