Отвечает Mark Shor:
Похоже это включается scandisk. Обычно такое происходит после неправильного выключения компьютера. Но если это каждый раз, возможно проблема с жестким диском, лучше заранее сохранить важные файлы где-нибудь еще.
Отвечает D.A.E.M.O.N.:
Это Windows проверяет файловую систему диска, где по её мнению есть ошибки. Такое бывает, если в системе есть разделы с файловой системой FAT32, или при включении компьютера в разъёме USB была оставлена флэшка. Оставлять флэшки воткнутыми в компьютер не рекомендуется. Также необходимо переконвертировать все разделы жёсткого диска в файловую систему NTFS, если не планируется использовать диск на компьютерах с Windows 9x/ME.