Хочу отформатировать свои диски С, D и установить Windows XP через загрузочную дискету, но в командной строке возникают ошибки. Какие-то файлы на ней испорчены. Как можно это исправить или подскажите другой способ форматирования дисков.

Просто запускай установку винды с CD. Только не в режиме восстановления, а новая установка. Он потом спросит, что делать с диском (на который устанавливаешь) - вот тогда и укажешь ему, что отформатировать (только делай быстрый формат - полный здесь не нужен). А диск D потом уже из-под винды отформатируешь (правой кнопкой на нем и там есть Форматировать).