Как сделать чтобы на компьютере было две учётных записи: Администратор и User, полностью ограниченный в своих правах?

Перейти на NTFS и установить права юзеру.

Под администратором создать пользователя с нужными правами через Управление компьютером, оттуда же удалить всех ненужных. Для ограничения прав убедитесь, что диски отформатированы в NTFS.

Да, в учетных записях пользователей можно создать нового с ограниченными правами, но у меня это и в Fat32 получилось.