Почему раздел С: (NTFS), куда я ставлю вот уже четвертый раз за эту неделю по новой Windows, становиться нечитаемым после работы в Windows из раздела D:?

Возможно, у вас диск больше 128 Гб при отсутствии поддержки его BIOS или системой, или диск поврежден.

Если у тебя винда 98 то она может не видеть ntfs диск.

Windows XP, в отличие от W2k видит первичные неактивные разделы (т.е. такой раздел нельзя примонтировать - назначить букву и т.п.). Для того, чтобы их увидеть (и примонтировать) в ХР можно воспользоваться одний оз программ: Paragon Mount Everything, 7tools Partition Manager, Paragon Ext2FS и т.п.