Как автоматом при загрузке запустить программу от имени другого пользователя? Установка сервисом не годится.

Воспользуйтесь командой RunAs. Справка по команде - в Центре справке и поддержки Windows или в консоли: runas /?.

Есть в свойствах ярлыка к программе"Запускать от имени другого пользователя"...

Стандартный планировщик вам поможет. (например надо пользователю назначить сетевой порт (net use lpt1....) а админские права давать ему неохота идем в планировщик создаём задание запускать нужный файлик(bat/cmd) при запуске windowsи вводим имя и пароль...