Отвечает TU-154:
Windows 98 на такой системе не обязана работать корректно - она не поддерживает такое железо. Наверняка у вас памяти 512М или больше - с таким объемом Windows 98 не работает корректно. В общем, единственный правильный выход - отказаться от Windows 98 и переходить на Windows XP.
Отвечает DOS:
Во время дефрагментации никаких программ, кроме explorer и самого дефрагментатора, не должно быть запущено!!!