Отвечает Shurovik:
Скорее всего, смотреть настройки перекодировщика и правильно его настроить.
Отвечает DeepLoneliness:
Можно перевернуть картинку в любом видео-редакторе.
Отвечает Тайнова Галина:
VirtualDub - просто и бесплатно.
Отвечает Андрей:
Нет, лучше Xilisoft Video Converter 3 (можно найти и бесплатно).