Отвечает Shurovik:
Если установлен соответствующий кодек (Matroska), то можно и VirtualDub.
Отвечает krypt:
Сам столкнулся с такой проблемой, мучился неделю, пока не нашел эту - поставь прогу XviD4PSP и не парься, лучшей я не знаю.
Отвечает u3ep:
С этой задачей отлично справляется программа MKV to AVI Converter.Качать здесь: http://www.008soft.com/mkv-to-avi.htm.