Отвечает Shurovik:
Ставьте VirtualDubMod - модификация оригинального VirtualDub'а, которая прекрасно работает с АС-3 звуком.
Отвечает Иван:
VirtualDub - это лишь оболочка для управления кодеками в вашей системе. Если она с чем-то не хочет работать, значит либо у вас нет этого кодека, либо надо обновить некоторые кодеки. Старые версии уже не подходят. Для установки и обновления всех кодеков пользуюсь пакетом K-Lite Codec Pack. Сейчас последние версии этого пакета имеют номера 2.72 (обычный пакет) и 1.53 (Mega пакет с дополнительными плеерами и примочками).