Отвечает TU-154:
Можно посоветовать закрывать не само приложение Excel (верхним крестиком), а только ненужный документ (крестиком, который находится ниже, в окне документа).
Отвечает ADv:
Наверное, нужно закрывать только одно MDI-окно.
Отвечает Alexey:
Нет такой настройки, просто закрывайте не через плавный крестик, а чуть пониже есть еще один кнопка-крестик, вот она и закрывает только одно окно!