Какими программами можно конвертировать видео файл Quick Time?

В форматы .mov и .qt? GX Transcoder.

Я пользуюсь и доволен Color7 Video Converter.

Я пользуюсь WinMPG Video konverter, не жалуюсь - быстрый и поддерживает много форматов, в том числе .mov и .qt.