Жесткий диск Seagate ST340810A 40Gb нагревается до 47-50 градусов в жаркую погоду, хотя под ним стоит кулер. Что ещё можно предпринять?

Поставить кулер помощнее. Ибо температура выше 40 для винта нежелательна - сокращает срок его службы.

Поставить вентилятор в корпус на фронтальную панель.

Для MB на chipset-ах intel доступна прога application accelerator, ищи на downloadfinder.intel.com для своего chipset-а. Она на самом деле является не акселератором, а замедлителем работы приложений, зато управляет оборотами, шумопроизводством и потреблением электричества для ATA винчестеров. Для SATA я пока подобных не находил.

Дополнительные вентиляторы на фронтальную панель (вдув внешнего воздуха) и на заднюю панель (выдув горячего воздуха) если позволяет корпус. Можно держать корпус открытым в жаркую погоду. Если всё совсем плохо, то открытый корпус обдувать внешним настольным вентилятором.