Есть компьютер и недавно работал с 2-мя винчестрерами (оба по 80 Gb Barracuda). Когда компьютер уже выключался, так получилось, выдернул вспомогательный HDD от основного и компьютер завис (надолго), пока я не подключил их обратно. Компьютер в конце концов выключился, но теперь проблема: тот, что Master HDD — не хочет определять

При подобном "горячем" включении-выключении устройств вы могли вывести из строя как сам винчестер, так и контроллер на материнской плате, что и произошло (зачем было нагорячую подключать винт обратно? Надо было вначале выключить компьютер...). Либо используйте теперь систему, как есть, ирадуйтесь, что после подобногоиздевательства хоть что-то еще работает, либо меняйте железо на новое(или попытайтесь отремонтировать в сервисе)и никогда больше так не экспериментируйте.