После удаления игры Matrix, остался какой-то «дополнительный» DVD-дисковод (F:), который так же «прописался» и в диспетчере устройств. Как его удалить?

Этот дополнительный дисковод появился в результате работы программ вроде Daemon Tools или Accohol 120%. Нужно запустить программу и удалить дисковод там, а затем удалить и её саму.

Наверное, это эмулятор диска (созданный программами вроде Daemon Tools или Accohol 120%). Некоторые игры требуют наличия CD-диска в дисководе, так вот распространенный способ это изменить - это эмуляторы дисков. Удаление - как сказал D.A.E.M.O.N.